截至2013年12月，徐州醫學院擁有國家級重點學科建設培育點1個；省級重點學科6個，省優勢學科群1個，“十二五”高校重點專業4個，省級醫學重點學科和重點臨床專科19個，江蘇省優秀學科梯隊1個，獲中央財政支持地方高校發展專項資金建設項目23項。擁有2個博士學位授權一級學科，碩士學位授權一級學科和臨床醫學專業學位授權點，具有碩士研究生推免權，并設有2個博士后科研工作站。