學校擁有3個國家重點學科、2個國家重點（培育）學科、37個省部（市）一級重點學科、18個博士后科研流動站。學校科研實力雄厚，建有北碚國家大學科技園、1個國家重點實驗室、1個國家工程技術研究中心、1個省部共建國家重點實驗室培育基地、10個教育部或農業部重點實驗室、2個國家野外科學觀測試驗站、2個農業部綜合實驗站、2個國土資源部野外基地、3個教育部工程研究中心、2個國家創新引智基地、3個教育部創新團隊、1個教育部人文社會科學重點研究基地。近五年來，學校科研立項數量和經費大幅增長，年增幅均達33%以上，獲“973”“863”國家社會科學基金重大委托項目等國家級項目700余項，獲得授權專利800余項，育成動植物新品種30個，出版專著600余部，發表各類論文13000余篇。“十二五”以來獲國家科技進步二等獎1項、省部級獎近100項。

序號	學科名稱	學科類別
1	哲學	一級
2	應用經濟學	一級
3	政治學	一級
4	社會學	一級
5	馬克思主義理論	一級
6	教育學	一級
7	心理學	一級
8	中國語言文學	一級
9	外國語言文學	一級
10	中國史	一級
11	數學	一級
12	物理學	一級
13	化學	一級
14	地理學	一級
15	生物學	一級
16	生態學	一級
17	計算機科學與技術	一級
18	農業工程	一級
19	環境科學與工程	一級
20	食品科學與工程	一級
21	作物學	一級
22	園藝學	一級
23	農業資源與環境	一級
24	植物保護	一級
25	畜牧學	一級
26	水產	一級
27	工商管理	一級
28	農林經濟管理	一級
29	音樂與舞蹈學	一級
30	美術學	一級
31	設計學	一級
32	法學	一級
33	體育學	一級
34	新聞傳播學	一級
35	統計學	一級
36	獸醫學	一級
37	中藥學	一級

1. 昆蟲基因組學與現代蠶絲學
2. 面向國家重大需求的心理學科創新建設
3. 基礎教育課程改革的深化與教學創新研究
4. 面向三峽庫區生態安全的生態學學科建設
5. 山地農業特色學科創新建設
6. 西南民族社會發展與西南研究特色學科構建

1. 生物學與分子化學
2. 教育與心理學科建設
3. 農業科學創新基地建設

1. “教師教育”優勢學科創新平臺
2. “現代農業科學”優勢學科創新平臺

一級學科博士點

序號	門類	一級學科名稱
1	哲學	哲學
2	教育學	教育學
3	教育學	心理學
4	文學	中國語言文學
5	文學	外國語言文學
6	歷史學	中國史
7	理學	數學
8	理學	化學
9	理學	生物學
10	理學	生態學
11	理學	統計學
12	工學	農業工程
13	工學	食品科學與工程
14	農學	作物學
15	農學	園藝學
16	農學	農業資源與環境
17	農學	植物保護
18	農學	畜牧學
19	管理學	農林經濟管理

一級學科碩士點

序號	門類	一級學科名稱
1	哲學	哲學
2	經濟學	應用經濟學
3	法學	政治學
4	法學	社會學
5	法學	民族學
6	法學	馬克思主義理論
7	教育學	教育學
8	教育學	心理學
9	教育學	體育學
10	文學	中國語言文學
11	文學	外國語言文學
12	文學	新聞傳播學
13	歷史學	中國史
14	歷史學	世界史
15	理學	數學
16	理學	物理學
17	理學	化學
18	理學	地理學
19	理學	生物學
20	理學	生態學
21	理學	統計學
22	工學	計算機科學與技術
23	工學	農業工程
24	工學	環境科學與工程
25	工學	食品科學與工程
26	工學	風景園林學
27	工學	軟件工程
28	農學	作物學
29	農學	園藝學
30	農學	農業資源與環境
31	農學	植物保護
32	農學	畜牧學
33	農學	獸醫學
34	農學	林學
35	農學	草學
36	醫學	中藥學
37	管理學	工商管理
38	管理學	農林經濟管理
39	管理學	公共管理
40	藝術學	藝術學理論
41	藝術學	音樂與舞蹈學
42	藝術學	戲劇與舞蹈學
43	藝術學	美術學
44	藝術學	設計學

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