2013年高考，上海海洋大學招收男女生比例無限制，但海洋漁業科學與技術專業對應的用人單位一般只招男生。據了解，上海海洋大學2013年高考對已投檔到上海海洋大學的考生按上海海洋大學招生政策實施校內加分（加分對象限上海考生，具體政策詳見上海海洋大學網站及招生簡章），以加分后的總分為依據，按專業志愿從高分到低分錄取，專業錄取不設專業志愿級差分；總分相同情況下，按語數外三門合計分數順序錄取；如語數外三門合計分數仍相同，理科按數學和外語合計分數順序錄取，文科按語文和外語合計分數順序錄取。對未進入專業志愿但同意調劑的考生作調劑錄取。日語及朝鮮語專業同等分數時優先錄取非英語語種考生。

高考錄取時，上海海洋大學按類招生專業的學生，入學第二年確定專業；含專業方向的專業學生入學后按學校規定時間確定專業方向。

在學費方面，上海海洋大學一般專業每生每學年最高不超過5000元（滬價行 [2000] 120號）；特殊熱門專業每生每學年最高不超過6500元（滬價行 [2000]120號）；中澳合作辦學專業每生每學年最高不超過15000元（滬教委財 [2005] 34號）。住宿費標準為每生每學年1200元。滬價費[2003]56號、滬財預[2003]93號、（滬教委財 [2012]118號）。